कुछ सालों बाद मनीषा के साथ कुछ ऐसा हुआ जिससे उनकी जीवन खत्म होते होते तो बच गई लेकिन 360 डिग्री बदल जरूर गई

 कहते हैं वो इतनी खूबसूरत थी कि फैंस उनके लिए खून से लव लेटर लिखते थे, कुछ तो यह तक कहते हैं कि राजीव मूलचंदानी जो कि ऐश्वर्या राय के बॉयफ्रेंड हुआ करते थे

अग्निसाक्षी के बाद मनीषा और नाना ने संजय लीला भंसाली के खामोशी में भी एक साथ काम किया जिसके लिए उन्होंने बेस्ट एक्ट्रेस अवॉर्ड तो जीता ही लेकिन उनकी और नाना की प्रेम लीला आग के तरह फैल गई। फिर दोनों ने अपना प्रेम कहानी सब को बताया उस समय नाना शादी शुदा थे और उनकी पत्नी नीला कणटी अलग रह रही थीं

इतने सारे हिट और पॉपुलर फिल्म देने के बाद वो बॉलीवुड से जैसे गायब ही हो गई। मनीषा के गायब हो जाने पर नाना पाटेकर कहते है एक इंटरव्यू में मै मनीषा के बारे में सोचता हु तो बहुत दुखी हो जाता हु ,

 लेकिन ये मनीषा गायब नहीं बल्कि कैंसर के इलाज के लिए अमेरिका गई वहां पे काफी चिकित्सा और दवाई के बाद। 2017 में उन्होंने केंसर से जंग जीत ली

मनीषा कोइराला से एक बात सभी को सीखना चाहिए कि इतने बार असफल होने बाद भी इंडस्ट्री में रुकी रही। चाहती तो अपने घर लौट जाती और चका चौंध वाली जीवन जीती लेकिन उनको अपने ऊपर विश्वाश था कि मुझे आगे बढ़ना है जंग जितना है और ऐसा हुआ भी अपने बुरे वक्त से लड़ा और जीत हासिल किया ।